抗生素抗性基因（ARGs）作为一类新兴的环境污染物，对全球的公众健康和生态系统带来了严重风险。人体中的耐药细菌及其携带的ARGs可以通过粪便和尿液等形式进入到污水中，最终汇集到市政污水处理厂。因此，通过测定污水中的ARGs可以用以估算污水收集区域居民的抗生素耐药规模。本研究的目的是筛选用来监测污水中病原菌特异性的基因标志物，以期推算人群耐药致病菌负载。研究以武汉市27座污水处理厂（包括郊区15座和市区12座）的宏基因组测序数据为基础，通过生物信息学分析，筛选了一些与人类致病菌相关的特异性的ARGs。通过设计特异性引物，对这27座污水处理厂的污水DNA进行实时荧光定量qPCR测定，并将qPCR结果与宏基因组测序的数据进行比较验证。结果表明，tetG、aadA、aad(6)、SAT-4和APH(3')-IIIa等ARGs在市区污水中的含量显著高于郊区。市区人群密集，更容易造成耐药性的传播。相反地，某些广泛报道的ARGs（如ermB和msrE），无法在市区和郊区污水中得到有效区分。qPCR结果与宏基因测序结果呈现出较好的一致性。基因标记物的潜在人类致病菌包括霍乱弧菌Vibrio cholerae，小肠结肠炎耶尔森菌Yersinia enterocolitica和金黄色葡萄球菌Staphylococcus aureus。因此，有必要采集更多城市和更多季节的污水对这些基因标志物的时空分布差异进行研究。

污水流行病学、致病菌、抗生素抗性基因、基因标志物