微生物是驱动元素生物地球化学循环的引擎和塑造地球宜居性的重要动力。微生物通常通过建立复杂的互作关系进行共存。除微生物直接介导碳循环过程之外，其种内和种间的互作模式及强度会改变群落结构组成并影响碳循环。为深入理解滨海湿地中这些微小生命形式及其复杂互作关系对其碳转化的影响，对我国不同类型的沿海湿地进行了野外调查，基于高通量测序以及基因芯片技术了解微生物互作模式、互作强度以及碳代谢潜能，同时结合碳稳定同位素（δ¹³C-POC、δ¹³C-DOC和δ¹³C-DIC）技术，综合运用多种数理统计方法，揭示了微生物互作在滨海湿地有机质降解过程中扮演的角色。结果发现，滨海湿地细菌主要由窄生态位的特异种构成，而古菌具有宽生态位的中性种和泛化种的分化；生态位的差异促使细菌与古菌共存。细菌偏好轻有机碳的降解（如淀粉、半纤维素），而古菌具有重有机碳（如纤维素、木质素和几丁质）降解的能力。种间竞争与合作共存，但以合作为主。细菌之间的合作促进较轻POC的降解；古菌首先作为初级分解者通过竞争性摄食介导较重POC的分解和DOC的释放，接着与细菌合作完成DOC的彻底降解。这一研究强调了微生物互作在碳循环中的重要地位，并为将其融入地球系统模型以预估气候变化提供了理论支撑。
 

滨海湿地，细菌，古菌，有机质，碳稳定同位素