河流物质输入形成河口区理化因子梯度的特殊生态位，具有维持生物多样性和保护渔业资源的重要功能。微生物在生源要素地化循环和生态系统维持中具有重要的调控作用，但河流输入条件下近海浮游微生物的响应特征研究尚显不足。我们在黄河口研究了河流输入对聚球藻种群和微生物群落的重要影响。聚球藻种群的研究发现，河口区营聚集态生活方式的聚球藻占比显著提高；高通量测序结果发现聚球藻S5.1亚簇的分支I在聚集态的比例显著高于自由态（p < 0.05），说明营聚集态生活方式的聚球藻有类群特异性；聚球藻与异养细菌之间的共现性网络也揭示了聚球藻和异养细菌间具有更强“小世界”特性和更高的鲁棒性，稳定性和抗干扰能力更强；在黄河口富含泥沙海域中压载矿物可能更利于聚球藻形成聚集态进而以颗粒有机碳的形式进行再循环和输出。微生物群落的研究发现，在48小时连续采样获得的群落结构中，受径流扰动不同的两个站位间形成明显聚类，其影响大于表底层生态位和昼夜节律形成的差异；强干扰条件下微生物多样性显著升高，差异物种与盐度和营养盐具有显著相关性；对群落构建过程的评估表明扩散限制主导了微生物群落构建，而在扰动强大较大的站位异质化选择存在更大的贡献度，水沙输入的确定性过程决定了微生物群落的构建。研究结果初步揭示了黄河口物质输入对近海浮游微生物群落的影响，进一步更长时间序列的研究将深化不同输入特征时段微生物群落稳态特征和构建过程的认识，形成河口区微生物群落演替机制的认知。

聚球藻，浮游微生物，响应特征，功能反馈，黄河口